News & events - Keyword : Genomics

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Génomique et bioinformatique

SHAPEIT4: un algorithme pour la génomique
à grande échelle

Les haplotypes constituent un ensemble de variations génétiques qui, situés côte à côte sur un même chromosome, sont transmis en un seul groupe à la génération suivant. Leur examen permet de comprendre l’héritabilité de certains traits complexes, comme par exemple le risque de développer plus tard une maladie. Cependant, pour effectuer cette analyse, il faut généralement disposer du génome des membres d’une même famille (les parents et leur enfant), un procédé long et cher.

Pour contourner ce problème, des chercheurs des groupes du Prof. Emmanouil Dermitzakis de l'Université de Genève et du Prof. Olivier Delaneau de l'Université de Lausanne, tous deux également au SIB, Institut Suisse de Bioinformatique, ont mis au point SHAPEIT4, un puissant algorithme informatique permettant d’identifier très rapidement les haplotypes de centaines de milliers d’individus sans lien familiaux, avec un résultat aussi fin que dans le cadre d’analyses familiales impossibles à mener à si large échelle. Leur outil est maintenant disponible en ligne sous licence open source, à la disposition libre de l’ensemble de la communauté des chercheurs. A découvrir dans la revue Nature Communications.

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Frontiers in Biomedicine - Jean-Pierre Hubaux

Data protection for personalized health

Jean-Pierre Hubaux
Laboratory for Data Security, School of Computer and Communication Sciences
EPFL - Lausanne, Switzerland

Thursday, December 5, 2019 - 12 h 30
CMU - Auditorium A. Franceschetti / C150

Host: Cem Gabay

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User symposium

iGE3 Genomics Platform user meeting

The next user symposium proposed by the Genomics Platform of iGE3 will take place on Friday, October 18, 2019, in room A04.2906 of the CMU, building A.

This event will feature speakers who will present their findings and experiences in using the services of the iGE3 Genomics Platform. The meeting will also be an opportunity to meet specialists from Thermo Fisher Scientific and Illumina for a presentation and discussion on the latest technological advances and solutions.

  • Attendance is free, but registration is required.
  • Registration: send an email to Mylene.Docquier@unige.ch.
  • Host: Mylene Docquier
SGF2019 banner

Swiss Genomics Forum 2019

As genome analysis becomes commonplace in research and clinics, Switzerland has much to offer in terms of scientific strength, quality of its healthcare system (including universal coverage) and detailed patient phenotyping.

The Swiss Genomics Forum 2019 (SGF2019) organized by the Health 2030 Genome Center will take place on September 27, 2019 at the Campus Biotech in Geneva. The SGF2019 will bring together researchers, clinicians, patient communities, and other stakeholder groups to meet and discuss the future of genomics around the following topics: genomics, diseases, personalized health, data and collaboration.